SARS-CoV-2 (COVID-19) Spike Variant Recombinant Proteins
Molte varianti del SARS-CoV-2 si stanno diffondendo nel mondo. Dalla dine del 2020, tre di loro hanno destato preoccupazione circa la loro potenzialmente aumentata trasmissibilità e letalità. L’attenzione di tutti si è principalmente concentrata sulle cosiddette varianti inglesi, sudafricana e brasiliana in quanto le mutazioni si concentrano principalmente nella proteina spike e questo potrebbe avere ripercussioni sull’efficacia dei vaccini attualmente in distribuzione (anche se molti esperti ribadiscono che tali vaccini saranno ancora funzionanti). Vista l’importanza di queste mutazioni, abbiamo preparato questo breve riassunto.
Table 1. VOC Nomenclature
| WHO label | Pango lineage | GISAID clade/lineage | Nextstrain clade | Earliest documented samples | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Alpha | B.1.1.7 | GRY (formerly GR/501Y.V1) | 20I/S:501Y.V1 | United Kingdom | ||||
| Beta | B.1.351 | GH/501Y.V2 | 20H/S:501Y.V2 | South Africa | ||||
| Gamma | P.1 | GR/501Y.V3 | 20J/S:501Y.V3 | Brazil | ||||
| Delta | B.1.617.2 | G/452R.V3 | 21A/S:478K | India |
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SARS-CoV-2 UK Variant
Verso la fine del 2020, il Regno Unito ha segnalato la variante B.1.1.7 variant (conosciuta anche come 20I/501Y.V1) che sembra essere significativamente più trasmissibile e forse più virulenta. Ad oggi, questa variante è stata identificata in almeno 62 paesi. 8 delle sue 23 mutazioni sono localizzate nella proteina spike, con la mutazione N501Y nel dominio RBD, la qual cosa desta una certa preoccupazione in quanto potrebbe comportare un’accresciuta affinità per la proteina umana ACE.
SARS-CoV-2 South Africa Variant
Nel gennaio 2021, la variante B.1.351 (conosciuta anche come 20H/501Y.V2) è stata identificata in Sud Africa. Presenta 21 mutazioni di cui 8 nella proteina spike. Come per le altre varianti in esame, include la mutazione N501Y ma anche altre due mutazioni nel dominio RBD (E484K, K417N). Sembra essere più trasmissibile e la mutazione E484K in particolare desta preoccupazione in quanto ha mostrato una riduzione al riconoscimento anticorpale. Come per la variante inglese, è stata rilevata in diversi paesi (almeno 20).
SARS-CoV-2 Brazil Variant
Verso la fine del Gennaio 2021, le autorità Giapponesi hanno riportato una nuova variante del Sars-CoV-2 ricavata da 4 viaggiatori brasiliani. Questa variante è conosciuta come P.1 (o anche 20J/501Y.V3) è ha 17 mutazioni, di cui 11 nella proteina spike. Alcuni dati suggeriscono che questa variante sia più trasmissibile e possa avere una certa capacità di sfuggire alla risposta immunitaria. Presenta le stesse 3 mutazioni della variante sudafricana, ed è stata identificata in diversi paesi.
B.1.617.2 (SARS-CoV-2 Delta)
Questa variante è stata rilevata per la prima volta nel Maharashtra, in India, nel dicembre 2020. La variante B.1.617.2 si caratterizza per dieci mutazioni nella proteina spike e può essere più resistente alla neutralizzazione da parte dei vaccini e di alcune terapie con anticorpi monoclonali.
Recombinant Proteins
Wild-type and Single Mutation Spike Protein
| Product Name Expression | System | Cat. No. | |
|---|---|---|---|
| Spike (ECD) protein, His tag (active) | HEK293 | GTX135972-pro | |
| Spike RBD protein, His tag (active) | HEK293 | GTX01546-pro | |
| Spike S1 protein, His tag (active) | HEK293 | GTX01554-pro | |
| Spike S2 (ECD) protein, mouse IgG Fc tag | HEK293 | GTX135684-pro | |
| Spike (D614G Mutant) protein (ECD), His tag (active) | HEK293 | GTX02575-pro |
501Y.V1 (UK Variant) Spike Proteins
501Y.V2 (South Africa Variant) Spike Proteins
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501Y.V3 (Brazil Variant) Spike Proteins
|
NEW: SARS-CoV-2 (COVID-19) Spike RBD (L452R, E484Q Mutant) protein, His tag (active)
Queste mutazioni (L452R, E484Q) si trovano nel RBD della variante SARS-CoV-2 India (B.1.617.1) (Kappa). Link